Η παρουσία της Alpha Bank στην Κύπρο ξεκίνησε το 1998 με την εξαγορά της Lombard Natwest Bank η οποία μετονομάσθηκε σε Alpha Bank Limited και αργότερα σε Alpha Bank Cyprus Ltd. Η Alpha Bank Cyprus Ltd είναι εταιρία του Ομίλου Alpha Bank με ποσοστό συμμετοχής 100%.

Το 1999 ο Όμιλος της Alpha Bank εξαγόρασε την ασφαλιστική εταιρία Metropolitan η οποία έκτοτε λειτουργεί με την επωνυμία Alpha Ασφαλιστική Λτδ.

Κατά τη διάρκεια του 2002, το 82% του μετοχικού κεφαλαίου της Alpha Ασφαλιστικής πέρασε στην ιδιοκτησία της Alpha Bank Cyprus Ltd. Παράλληλα η Alpha Bank Ελλάδος εξαγόρασε το σύνολο των μετοχών που κατείχαν οι μέτοχοι μειοψηφίας της Alpha Bank Cyprus Ltd, και απέκτησε το 100% του μετοχικού της κεφαλαίου.

Τον Απρίλιο του 2004 η Alpha Bank Cyprus Ltd εισήγαγε με επιτυχία ένα νέο ολοκληρωμένο τραπεζικό σύστημα, το οποίο παρέχει στους χρήστες ένα πολύ φιλικό και λειτουργικό περιβάλλον εργασίας μέσα από απλοποιημένες διαδικασίες.

Το 2007 η επιτυχής παρουσία της Alpha Bank στην Κύπρο εδραιώθηκε περαιτέρω με την απόκτηση ιδιόκτητων γραφείων συνολικής επιφάνειας 4.600 τ.μ. σε ένα σύγχρονο κτίριο σε κεντρικό σημείο της πρωτεύουσας. Στο νέο ιδιόκτητο κτίριο στεγάζονται όλες οι Κεντρικές Υπηρεσίες καθώς και το νέο Κεντρικό Κατάστημα Λευκωσίας.

Το 2008 η Alpha Bank Cyprus Ltd συμπλήρωσε τα 10 χρόνια λειτουργίας της στην Κύπρο και εγκαινίασε το νέο κτίριο Γενικής Διευθύνσεως.

Το 2010 η Τράπεζα έθεσε σε λειτουργία το νέο σύστημα ηλεκτρονικής τραπεζικής Alpha Mobile Banking, μέσω της υπηρεσίας Alpha Express Banking, για την παροχή τραπεζικών υπηρεσιών μέσω κινητού τηλεφώνου, με τεχνολογία ειδικά σχεδιασμένη για κινητά.

Tην 1η Φεβρουαρίου 2013, σε συνέχεια της συμφωνίας εξαγοράς της Εμπορικής Τραπέζης την 16 Οκτωβρίου 2012 από την Alpha Bank A.E. μετά της Credit Agricole S.A. και της λήψεως των οικείων κανονιστικών εγκρίσεων από τις Ελληνικές και Κυπριακές Κεντρικές Τράπεζες και Επιτροπές Ανταγωνισμού, το σύνολο του μετοχικού κεφαλαίου της Εμπορικής μεταβιβάστηκε από την Credit Agricole στην Alpha Bank.

Στόχος της Τραπέζης καθ’ όλη τη διάρκεια της λειτουργίας της στην Κύπρο, είναι πρωτίστως η ικανοποίηση των αναγκών των πελατών της και το οικονομικό τους συμφέρον. Τα προϊόντα που παρέχει προσαρμόζονται στις απαιτήσεις των πελατών και τις συνθήκες της αγοράς, με σκοπό την προσφορά συγκριτικού πλεονεκτήματος στους πελάτες σε σχέση με τον ανταγωνισμό, έτσι ώστε να αποκτούν πραγματικό όφελος και να δημιουργείται αξία από τη συνεργασία τους με την Alpha Bank.